Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn3Q9WUK7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn3Q9WUK7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn3Q9WUK7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn3Q9WUK7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn3Q9WUK7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn3Q9WUK7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms