Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpk1Q9R0M5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpk1Q9R0M5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpk1Q9R0M5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpk1Q9R0M5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpk1Q9R0M5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpk1Q9R0M5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpk1Q9R0M5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms