Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hsf4Q9R0L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hsf4Q9R0L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hsf4Q9R0L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hsf4Q9R0L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hsf4Q9R0L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hsf4Q9R0L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233 ms