Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AmfrQ9R049 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AmfrQ9R049 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AmfrQ9R049 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AmfrQ9R049 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AmfrQ9R049 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AmfrQ9R049 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AmfrQ9R049 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AmfrQ9R049 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms