Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubqln2Q9QZM0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubqln2Q9QZM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubqln2Q9QZM0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubqln2Q9QZM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubqln2Q9QZM0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubqln2Q9QZM0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ubqln2Q9QZM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubqln2Q9QZM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms