Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Usp21Q9QZL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Usp21Q9QZL6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Usp21Q9QZL6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Usp21Q9QZL6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Usp21Q9QZL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Usp21Q9QZL6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Usp21Q9QZL6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Usp21Q9QZL6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Usp21Q9QZL6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Usp21Q9QZL6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Usp21Q9QZL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms