Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clec4aQ9QZ15 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4aQ9QZ15 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clec4aQ9QZ15 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4aQ9QZ15 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4aQ9QZ15 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec4aQ9QZ15 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4aQ9QZ15 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec4aQ9QZ15 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4aQ9QZ15 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4aQ9QZ15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4aQ9QZ15 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms