Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdh11Q9QYF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh11Q9QYF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rdh11Q9QYF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdh11Q9QYF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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