Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkp3Q9QY23 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp3Q9QY23 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkp3Q9QY23 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkp3Q9QY23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkp3Q9QY23 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pkp3Q9QY23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pkp3Q9QY23 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp3Q9QY23 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp3Q9QY23 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp3Q9QY23 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkp3Q9QY23 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms