Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trp53inp1Q9QXE4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trp53inp1Q9QXE4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trp53inp1Q9QXE4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trp53inp1Q9QXE4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trp53inp1Q9QXE4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trp53inp1Q9QXE4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trp53inp1Q9QXE4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms