Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clca3a1Q9QX15 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clca3a1Q9QX15 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clca3a1Q9QX15 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca3a1Q9QX15 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca3a1Q9QX15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca3a1Q9QX15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clca3a1Q9QX15 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms