Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcea2Q9QVN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcea2Q9QVN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcea2Q9QVN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcea2Q9QVN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tcea2Q9QVN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcea2Q9QVN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcea2Q9QVN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms