Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh9a1Q9JLJ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh9a1Q9JLJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms