Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgm1Q9JLF6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms