Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bace2Q9JL18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bace2Q9JL18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bace2Q9JL18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace2Q9JL18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace2Q9JL18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace2Q9JL18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace2Q9JL18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms