Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfhx4Q9JJN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfhx4Q9JJN2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfhx4Q9JJN2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfhx4Q9JJN2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfhx4Q9JJN2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfhx4Q9JJN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfhx4Q9JJN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms