Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc86Q9JJ89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc86Q9JJ89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc86Q9JJ89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc86Q9JJ89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc86Q9JJ89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc86Q9JJ89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc86Q9JJ89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc86Q9JJ89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc86Q9JJ89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms