Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sp6Q9ESX2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sp6Q9ESX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sp6Q9ESX2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sp6Q9ESX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sp6Q9ESX2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sp6Q9ESX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms