Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DysfQ9ESD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DysfQ9ESD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DysfQ9ESD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DysfQ9ESD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DysfQ9ESD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DysfQ9ESD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DysfQ9ESD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DysfQ9ESD7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DysfQ9ESD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DysfQ9ESD7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DysfQ9ESD7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms