Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm3Q9ERZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm3Q9ERZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrm3Q9ERZ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrm3Q9ERZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrm3Q9ERZ3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrm3Q9ERZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrm3Q9ERZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms