Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI5

Jmjd6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd6Q9ERI5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd6Q9ERI5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Jmjd6Q9ERI5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd6Q9ERI5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd6Q9ERI5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd6Q9ERI5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Jmjd6Q9ERI5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd6Q9ERI5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd6Q9ERI5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms