Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco1c1Q9ERB5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco1c1Q9ERB5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco1c1Q9ERB5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco1c1Q9ERB5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms