Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tlr9Q9EQU3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tlr9Q9EQU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Tlr9Q9EQU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tlr9Q9EQU3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Tlr9Q9EQU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tlr9Q9EQU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Tlr9Q9EQU3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tlr9Q9EQU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tlr9Q9EQU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms