Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgap1Q9EPJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfgap1Q9EPJ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgap1Q9EPJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgap1Q9EPJ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arfgap1Q9EPJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms