Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aph1cQ9DCZ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aph1cQ9DCZ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aph1cQ9DCZ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aph1cQ9DCZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aph1cQ9DCZ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aph1cQ9DCZ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aph1cQ9DCZ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aph1cQ9DCZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aph1cQ9DCZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aph1cQ9DCZ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aph1cQ9DCZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aph1cQ9DCZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms