Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fam213bQ9DB60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam213bQ9DB60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam213bQ9DB60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam213bQ9DB60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam213bQ9DB60 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam213bQ9DB60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam213bQ9DB60 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms