Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm2bQ9DAC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cmtm2bQ9DAC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cmtm2bQ9DAC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm2bQ9DAC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms