Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmbim4Q9DA39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmbim4Q9DA39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmbim4Q9DA39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmbim4Q9DA39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmbim4Q9DA39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmbim4Q9DA39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmbim4Q9DA39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmbim4Q9DA39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmbim4Q9DA39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms