Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp12Q9D9M2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp12Q9D9M2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp12Q9D9M2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp12Q9D9M2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp12Q9D9M2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp12Q9D9M2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp12Q9D9M2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp12Q9D9M2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp12Q9D9M2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp12Q9D9M2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp12Q9D9M2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp12Q9D9M2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp12Q9D9M2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms