Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arpc5lQ9D898 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arpc5lQ9D898 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arpc5lQ9D898 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arpc5lQ9D898 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arpc5lQ9D898 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arpc5lQ9D898 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arpc5lQ9D898 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arpc5lQ9D898 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arpc5lQ9D898 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms