Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D727 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D727 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D727 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D727 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D727 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D727 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D727 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D727 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D727 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D727 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D727 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D727 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D727 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D727 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D727 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D727 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D727 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D727 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D727 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D727 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D727 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D727 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D727 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D727 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D727 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D727 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D727 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D727 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D727 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D727 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D727 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D727 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D727 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D727 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D727 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D727 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D727 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D727 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D727 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D727 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D727 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D727 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D727 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D727 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D727 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D727 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D727 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D727 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D727 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D727 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D727 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D727 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D727 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D727 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D727 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D727 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D727 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D727 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D727 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D727 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D727 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D727 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D727 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D727 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D727 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D727 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D727 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D727 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D727 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D727 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D727 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D727 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D727 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D727 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D727 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D727 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D727 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D727 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D727 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D727 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D727 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D727 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D727 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D727 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D727 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D727 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D727 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D727 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D727 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D727 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D727 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D727 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms