Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspb11Q9D6H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspb11Q9D6H2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hspb11Q9D6H2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hspb11Q9D6H2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb11Q9D6H2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb11Q9D6H2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspb11Q9D6H2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb11Q9D6H2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb11Q9D6H2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hspb11Q9D6H2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hspb11Q9D6H2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms