Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabra4Q9D6F4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabra4Q9D6F4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabra4Q9D6F4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra4Q9D6F4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra4Q9D6F4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabra4Q9D6F4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms