Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnbd2Q9D5U8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnbd2Q9D5U8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnbd2Q9D5U8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnbd2Q9D5U8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnbd2Q9D5U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnbd2Q9D5U8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnbd2Q9D5U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnbd2Q9D5U8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnbd2Q9D5U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnbd2Q9D5U8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms