Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lpcat2bQ9D5U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lpcat2bQ9D5U0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpcat2bQ9D5U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpcat2bQ9D5U0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lpcat2bQ9D5U0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lpcat2bQ9D5U0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lpcat2bQ9D5U0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms