Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930556J24RikQ9D4U7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930556J24RikQ9D4U7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms