Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf6Q9D4J7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf6Q9D4J7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phf6Q9D4J7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phf6Q9D4J7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phf6Q9D4J7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf6Q9D4J7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf6Q9D4J7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf6Q9D4J7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf6Q9D4J7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf6Q9D4J7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf6Q9D4J7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf6Q9D4J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Phf6Q9D4J7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms