Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gcc1Q9D4H2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gcc1Q9D4H2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Gcc1Q9D4H2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gcc1Q9D4H2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Gcc1Q9D4H2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Gcc1Q9D4H2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Gcc1Q9D4H2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Gcc1Q9D4H2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gcc1Q9D4H2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms