Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syce1Q9D495 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syce1Q9D495 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syce1Q9D495 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syce1Q9D495 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syce1Q9D495 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Syce1Q9D495 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syce1Q9D495 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Syce1Q9D495 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms