Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arl13aQ9D416 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arl13aQ9D416 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl13aQ9D416 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl13aQ9D416 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl13aQ9D416 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl13aQ9D416 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl13aQ9D416 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arl13aQ9D416 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.7 ms