Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klhdc8bQ9D2D9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhdc8bQ9D2D9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhdc8bQ9D2D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhdc8bQ9D2D9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc8bQ9D2D9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc8bQ9D2D9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms