Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nol3Q9D1X0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nol3Q9D1X0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nol3Q9D1X0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nol3Q9D1X0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nol3Q9D1X0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms