Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MceeQ9D1I5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MceeQ9D1I5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MceeQ9D1I5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MceeQ9D1I5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MceeQ9D1I5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MceeQ9D1I5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MceeQ9D1I5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MceeQ9D1I5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MceeQ9D1I5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms