Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cysrt1Q9D1E4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cysrt1Q9D1E4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cysrt1Q9D1E4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cysrt1Q9D1E4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cysrt1Q9D1E4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cysrt1Q9D1E4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cysrt1Q9D1E4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cysrt1Q9D1E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms