Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cthrc1Q9D1D6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cthrc1Q9D1D6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cthrc1Q9D1D6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cthrc1Q9D1D6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cthrc1Q9D1D6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cthrc1Q9D1D6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cthrc1Q9D1D6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms