Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syf2Q9D198 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syf2Q9D198 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syf2Q9D198 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syf2Q9D198 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syf2Q9D198 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syf2Q9D198 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syf2Q9D198 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syf2Q9D198 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syf2Q9D198 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syf2Q9D198 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syf2Q9D198 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syf2Q9D198 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms