Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem53Q9D0Z3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem53Q9D0Z3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem53Q9D0Z3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem53Q9D0Z3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem53Q9D0Z3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms