Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdca7Q9D0M2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdca7Q9D0M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdca7Q9D0M2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdca7Q9D0M2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdca7Q9D0M2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdca7Q9D0M2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cdca7Q9D0M2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdca7Q9D0M2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdca7Q9D0M2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdca7Q9D0M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdca7Q9D0M2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdca7Q9D0M2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdca7Q9D0M2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdca7Q9D0M2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdca7Q9D0M2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdca7Q9D0M2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdca7Q9D0M2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.4 ms