Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mms19Q9D071 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mms19Q9D071 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mms19Q9D071 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mms19Q9D071 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mms19Q9D071 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mms19Q9D071 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mms19Q9D071 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mms19Q9D071 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mms19Q9D071 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mms19Q9D071 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mms19Q9D071 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms