Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl35Q9CZ49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl35Q9CZ49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl35Q9CZ49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl35Q9CZ49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl35Q9CZ49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl35Q9CZ49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl35Q9CZ49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms